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北京超算+深勢科技,共同打造藥物計算新范式

 2022-07-27 11:20  來源:互聯(lián)網(wǎng)  我來投稿 撤稿糾錯

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醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)是與國民經(jīng)濟和民生息息相關的基礎和戰(zhàn)略性產(chǎn)業(yè)。根據(jù)《Nature》報道,新藥開發(fā)的平均成本約為26 億美元,大約需要10 年,包括小分子化合物的長期開發(fā)階段、Ⅲ期臨床試驗以及注冊批準過程,其中,只有不到1 /10 的藥物可以成功通過并上市。高投入、高風險、低回報,一直是藥企新藥研發(fā)的痛點。

而人工智能技術的出現(xiàn),給整個醫(yī)藥領域帶來巨大的變革。借助AI模型介入靶點結構解析、預測與精修、苗頭化合物篩選、先導化合物優(yōu)化和ADME/T性質預測等諸多環(huán)節(jié),能夠有效加快藥物研發(fā)速度,降低研發(fā)成本,提高研發(fā)成功率,進而提升藥企的投資回報率。這種通過AI學習底層原理或解決底層問題,再進一步解決這些原理所映射的工業(yè)問題的方法,就是所謂的“AI for Science”新范式。

成立于2018年的深勢科技,是AI for Science科學研究范式的先行者 。深勢科技致力于運用人工智能和分子模擬算法,結合先進計算手段求解重要科學問題,為人類文明最基礎的生物醫(yī)藥、能源、材料和信息科學與工程研究打造新一代微尺度工業(yè)設計和仿真平臺。創(chuàng)新性地融合了跨尺度建模、高效采樣、高性能計算等技術,在保持量子力學精度準確性的基礎上,將分子動力學的計算速度提升了數(shù)個數(shù)量級,從而解決藥物和材料的微觀計算模擬難題。

在輔助藥物研發(fā)、實現(xiàn)藥物分子的理性發(fā)現(xiàn)和設計方面,深勢科技推出的Hermite™藥物計算設計平臺 ,致力于為藥物研發(fā)工作者提供臨床前的一站式解決方案。平臺融合了蛋白結構預測Uni-Fold、自由能微擾計算Uni-FEP等核心算法,為藥物研發(fā)工作者提供了一系列全新的計算模擬及設計工具,已被國內外數(shù)十家創(chuàng)新藥企和上千位學術用戶廣泛應用。同時,基于平臺能力,深勢科技與業(yè)內多家合作伙伴建立了十余條合作管線,覆蓋包括CNS、腫瘤和自身免疫性疾病等領域,目前部分管線已處于Pre-PCC階段。

公司核心團隊由中國科學院院士領銜,主要來自北京大學、普林斯頓大學、約翰霍普金斯大學、復旦大學、中科院上海藥物研究所、阿里、百度等世界一流高校、科研機構和企業(yè),科研隊伍由物理建模、數(shù)值算法、機器學習、高性能計算及藥物和材料計算等多個領域的數(shù)十名優(yōu)秀青年科學家構成。

團隊核心成員獲得2020年全球計算機高性能計算領域的最高獎項“戈登貝爾”獎 ,相關工作也入選由中國科學院院士和中國工程院院士投票評選的2020年中國十大科技進展

深度勢能團隊獲得戈登貝爾獎,圖源:深勢科技

在提供基礎算力服務上,深勢科技Hermite藥物設計平臺與北京超算合作,共同突破了藥物設計平臺基于超算架構的云原生技術 ,實現(xiàn)了在跨尺度建模、高效采樣、高性能計算等技術上的創(chuàng)新突破,在保持量子力學精度準確性的基礎上,將分子動力學的計算速度提升了數(shù)個數(shù)量級。

北京超算充分發(fā)揮資源優(yōu)勢,為深勢科技打造藥物設計和材料研發(fā)平臺提供了強有力的適配算力支撐,助力其實現(xiàn)真正的創(chuàng)新驅動發(fā)展,從以下方面為深勢科技提供了強力護航:

上萬+核/上百+卡算力秒級匯聚,無需等待時間;

裸金屬CPU核心/GPU卡,節(jié)點間高速IB網(wǎng)絡通信,以最低的價格實現(xiàn)最高的計算效率;

從計算任務開始計算為計費起點,真正按需收費,精確到秒級;

支持Docker,容器化調度等云原生技術,協(xié)助研發(fā)以及生產(chǎn)環(huán)境流程化協(xié)作;

生命科學專業(yè)技術團隊以及算法優(yōu)化團隊專業(yè)支持業(yè)務流全棧定制化服務;

未來,北京超算將繼續(xù)與深勢科技這樣的創(chuàng)新AI企業(yè)展開深度合作,將AI+HPC的模式推行至整個藥物研發(fā)行業(yè),助力AI制藥生產(chǎn)實踐難題破解,開辟企業(yè)降本增效新路徑,共拓生命科學行業(yè)新生態(tài)。

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